La Conférence des présidents d’université (CPU), est un réseau d’universités publiques (les 12 universités) qui s’est adjoint les 5 universités créées dans le cadre du partenariat public-privé. Elle est composée des présidents d’universités membres. La CPU est un espace d’échange sur les questions de l’enseignement supérieur et de la recherche scientifique et une force de proposition auprès du Ministère de l’Enseignement Supérieur. Elle coordonne les réseaux des établissements publics d’enseignement supérieur. Elle est présidée par un président d’université désigné par le ministre (actuellement présidée par le président de l’UIT-Kénitra).

Elle se réunie à la demande du Ministre ou du président de la CPU, pour examiner des questions diverses, pour être consultée ou pour harmoniser des actions à caractère national (rentrée universitaire, réformes de l’enseignement ou de recherche scientifique, coopération,…).